NEBNext Automation

Avec la capacité croissante des séquenceurs et le nombre grandissant dʼapplications de séquençage nécessitant une préparation dʼéchantillons à haut débit, les utilisateurs NGS se tournent de plus en plus vers lʼautomatisation. En effet, la préparation et la quantification manuelles de nombreuses banques dʼacides nucléiques constituent un facteur limitant dans le processus de séquençage, et leur automatisation est en passe de devenir une solution incontournable à ce problème.

Avantages:
  • Augmentation de la cadence
  • Amélioration de la reproductibilité
  • Accélération du processus
  • Réduction du temps de manipulation
  • Réduction de l'incidence des troubles musculosquelettiques

Les produits NEBNext® sont conçus dans une optique dʼautomatisation :

  • Un nombre de composants limité, pour une automatisation simplifiée
  • Des flux de travail rationalisés, avec minimisation de la consommation de cônes de pipette et des risques dʼerreurs de pipetage
  • Une consommation moindre en billes de purification, pour un coût par réaction réduit
  • De meilleurs résultats de séquençage avec de faibles quantités dʼéchantillons de départ (de lʼordre du ng pour lʼADN/ARN et du pg pour lʼADN immunoprécipité par ChIP)
  • Des réactifs robustes offrant des rendements globaux plus élevés pour vos librairies
  • Des volumes de réactifs adaptés aux protocoles automatisés

Des méthodes automatisées utilisant les kits NEBNext ont été développées par différents fournisseurs de plateformes, notamment Beckman Coulter®, Hamilton® et PerkinElmer®.

NEBNext Ultra Directional RNA Library Prep Kit for Illumina sur Biomek, pour une préparation automatisée à haut débit, reproductible et à rendement élevé de banques dʼARN complexes : dans ce webinaire, Fiona Stewart (New England Biolabs) et Zach Smith (Beckman Coulter) présentent la construction de librairies directionnelles à lʼaide de ce kit et abordent lʼautomatisation de cette méthode sur Biomek.

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EBNext Fast Fragmentation & DNA Library Prep Set for Ion Torrent sur Biomek, pour une préparation automatisée à haut débit, reproductible et à rendement élevé de banques dʼADN complexes : dans ce webinaire, Joanna Hamilton (Genomics and Molecular Biology Shared Resources, Dartmouth College), Lynne Apone (New England Biolabs) et Zach Smith (Beckman Coulter) présentent ce kit, lʼautomatisation de cette méthode et sa mise en œuvre dans différents flux de travail au sein dʼune plateforme de séquençage.

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Banques de contrôle (ADNg dʼE. coli K12) construites avec la méthode automatisée NEBNext Ultra DNA sur la plateforme Biomek®

NEBNext Automation

Les graphes obtenus pour six banques de contrôle (E. coli K12) sur Agilent® 2200 TapeStation à lʼaide de D1000 ScreenTape montrent des résultats reproductibles. Pour plus dʼinformations, consulter la note dʼapplication intitulée Automated DNA Library Construction Using the NEBNext Ultra DNA Library Prep Kit for Illumina® on the Beckman Coulter Biomek FXP Automated Liquid Handler (Construction automatisée de banques dʼADN avec NEBNext Ultra DNA Library Prep Kit for Illumina® sur lʼautomate de pipetage Biomek FXP de Beckman Coulter).

Test de contamination croisée en damier sur la plateforme STARlet™ de Hamilton

NEBNext Automation

Graphes obtenus sur Bioanalyzer DNA 1000 pour les puits A1-A6 du test en damier avec des échantillons dʼeau et dʼADN dʼE. coli. Les données représentatives dʼune analyse de 48 échantillons montrent lʼabsence de contamination croisée entre les différents puits. Pour plus dʼinformations, consulter la note dʼapplication intitulée Automated Library Preparation using NEBNext® Ultra™ DNA Library Prep Kit for Illumina® (E7370) on the HAMILTON STAR Line (Préparation automatisée de banques dʼADN avec NEBNext® Ultra™ DNA Library Prep Kit for Illumina® [réf. E7370] sur un instrument STAR de Hamilton).

Notes d’Application sur l’automatisation à télécharger :

Beckman Coulter: Automated DNA Library Construction Using the NEBNext Ultra DNA Library Prep Kit for Illumina® on the Beckman Coulter Biomek FXP Automated Liquid Handler

Beckman Coulter: Automated Directional RNASeq Library Preparation using the Biomek FXP Liquid Handler

Hamilton: Automated Library Preparation using NEBNext® Ultra™ DNA Library Prep Kit for Illumina® (E7370) on the HAMILTON® STAR™ Line

Sage Science: Automated size selection of NEBNext Small RNA libraries with the Sage Pippin Prep

Tecan: Automated NEBNext® Ultra™ II DNA Library Preparation for Illumina®

Plus d’informations disponibles dans la section Ressources Techniques ou sur neb.com