NEBNext RNA Depletion

NEBNext rRNA & Globin mRNA Depletion Kits

NEBNext rRNA Depletion Kit

NEBNext rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat) permet dʼéliminer efficacement les ARN ribosomiques (ARNr) des échantillons dʼARN totaux humains, de souris et de rat. Ce kit offre dʼexcellents résultats quels que soient la qualité et lʼétat de lʼARN (intact ou dégradé, y compris FFPE). La déplétion des ARNr (pour des quantités d’échantillons initiaux allant de 10 ng à 1 μg) prend environ 2 heures, avec moins de 10 minutes de manipulation.

Avantages:
  • Un seul kit avec des performances optimales pour tous vos échantillons dʼARN :
  • ARN dégradé (FFPE) ou intact
  • Quantités d’échantillons initiaux allant de 10 ng à 1 μg
  • Élimine plus de 95 % des ARNr et permet dʼobtenir de meilleures lectures pour vos échantillons
  • Offre une vue plus complète du transcriptome grâce à la rétention des ARN non codants et incomplets, qui sont perdus avec les méthodes dʼenrichissement en ARNm polyadénylés par hybridation à des oligo d(T)
  • Convient aux échantillons humains, de souris et de rat
  • Facile à intégrer en amont de nʼimporte quel protocole de synthèse dʼADNc à partir dʼamorces aléatoires
  • Finies les préparations « maison » : un kit validé NGS, fiable et pratique pour la déplétion des ARNr avec la méthode de la RNase H

Note d’application : Selective depletion of abundant RNAs to enable transcriptome analysis of low-input and highly-degraded RNA from FFPE breast cancer samples (Déplétion sélective dʼARN abondants à partir de faibles quantités dʼARN fortement dégradés issus dʼéchantillons FFPE de tumeurs du sein en vue de lʼanalyse du transcriptome)

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NEBNext rRNA Depletion Kit Workflow
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NEB_NEBNext rRNA Depletion Workflow

Nouveau: Kit de déplétion NEBNext Globin & ARNr

L’ARNm de la globine et les ARNr sont très abondants dans les échantillons de sang, et leur élimination spécifique et efficace est souhaitable afin de révéler la signification biologique des transcrits moins abondants.

Les NEBNext Globin & rRNA Depletion Kits (Human / Mouse / Rat) utilisent le protocole de déplétion d’ARN avec la NEBNext RNase H pour retirer l’ARNm de globine, l’ARNr cytoplasmique et l’ARNm mitochondrial sur les échantillons humains, de souris et de rats. Cette méthode est efficace avec l’ARN intact et dégradé.

Avantages:
  • Déplétion spécifique et efficace de l'ARNm de la globine et de l'ARNr
  • Convient pour l'ARN de faible ou de haute qualité
  • Compatible avec une large gamme de quantités d’échantillon : 10 ng - 1 μg
  • Intégration facultative avec les flux de travail d'isolement de l'ARNm poly (A) pour l'élimination des ARN de globine, des ARNr et des ARN non codants
  • Protocole rapide : 2 heures, avec moins de 10 minutes de pipetage
  • Également disponible avec des billes de purification d'échantillons d'ARN

Nouveau: NEBNext rRNA Depletion Kit (Bacteria)

L’ARN ribosomal (ARNr) est très abondant dans les échantillons bactériens, et son élimination est souhaitable afin de révéler la signification biologique des transcrits moins abondants. L’enrichissement spécifique des ARNm bactériens est difficile en raison de leur manque de queues poly (A), et faire le contraire – élimination spécifique et efficace de l’ARNr bactérien – est donc nécessaire.

Le NEBNext rRNA Depletion Kit (Bacteria) utilise le protocole de déplétion d’ARN basé sur la NEBNext RNase H pour cibler l’élimination de l’ARNr des organismes Gram positif et Gram négatif. La méthode est efficace avec de l’ARN intact et dégradé, provenant de monocultures ou d’échantillons avec des espèces bactériennes mixtes (par exemple, méta-transcriptomique).

Avantages:
  • Déplétion spécifique et efficace des ARNr bactériens (5S, 16S, 23S)
  • Compatible avec les organismes Gram positif et Gram négatif
  • Efficace avec les monocultures et le mélange d'espèces bactériennes (par exemple, méta-transcriptome)
  • Compatible avec une large gamme de quantités d’échantillon : 10 ng - 1 µg
  • Convient pour l'ARN de faible ou de haute qualité
  • Protocole rapide : 2 heures, avec moins de 10 minutes de pipetage

Liste des bactéries testées avec le RNA Depletion Kit

1006
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Assistant de recherche
Institution de recherche biomédicale

“La ribo-déplétion bactérienne NEB a permis de dépleter les ARNr de façon équivalente voire supérieure à notre précédente technique de référence pour la ribo-déplétion dans une large gamme de qualité RIN. Nous avons été satisfaits de la flexibilité des quantités d’entrée d’ARN total et nous avons systématiquement obtenu une ribo-déplétion efficace en partant de 100 ng d’ARN total dans les isolats simples et les échantillons méta-génomiques. Le protocole est également plus ergonomique que les protocoles de ribo-déplétion à base de billes. De toutes les nouvelles méthodes de ribo-déplétion bactérienne que nous avons testées, celle de NEB était de loin la meilleure.”

Liste des produits disponibles

PRODUIT REF. COND. PRIX
Nouveau NEBNext rRNA Depletion Kit (Bacteria) with RNA Sample Purification Beads E7860S 6 rxns shop_icon
E7860L 24 rxns shop_icon
E7860X 96 rxns shop_icon
Nouveau NEBNext rRNA Depletion Kit (Bacteria) E7850S 6 rxns shop_icon
E7850L 24 rxns shop_icon
E7850X 96 rxns shop_icon
NEBNext rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat) E6310S 6 rxns shop_icon
E6310L 24 rxns shop_icon
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Nouveau NEBNext Globin & rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat) E7750S 6 rxns shop_icon
E7750L 24 rxns shop_icon
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Nouveau NEBNext Globin & rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat) with RNA Sample Purification Beads E7755S 6 rxns shop_icon
E7755L 24 rxns shop_icon
E7755X 96 rxns shop_icon
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