ℹ️ Produit discontinué
Merci de vous rendre sur cette page : NEBNext Direct Genotyping Solution for Illumina
Les NEBNext Direct Custom Ready Panels reposent sur la méthode unique d’enrichissement par hybridation NEBNext Direct et permettent de créer rapidement des panels de gènes cibles sur mesure pour le séquençage Illumina. Nous proposons une liste de gènes pour lesquels des sondes ont été minutieusement développées et optimisées de manière à offrir une couverture complète des régions codantes. Vous pouvez concevoir des panels de qualité en combinant les gènes de votre choix. Avec NEBNext Direct Custom Ready Panels, vous obtenez rapidement des panels adaptés à vos besoins tout en bénéficiant de performances optimales.
Cliquer ici pour en savoir plus sur la technologie d’enrichissement ciblé NEBNext Direct
- Nombre de gènes au choix (d'un seul à plusieurs centaines)
- Spécificité et uniformité de couverture inégalées
- Élimination des étapes de synthèse et d'optimisation, pour des délais plus courts
- Sensibilité accrue avec notre Unique Molecule Index (UMI)
- Des résultats en un jour avec notre flux de travail automatisable
Les NEBNext Direct Custom Ready Panels offrent des performances optimales pour différentes tailles de panel.
Les principales métriques d’enrichissement ciblé montrent des performances constantes pour différentes tailles de panel. 100 ng d’ADN ont été soumis à des tests de panels de 1, 10, 25, 50 et 100 gènes, et à un séquençage d’extrémités appariées Illumina (150 pb). Les panels de grande taille comprenaient tous les gènes des panels de petite taille.
Sensibilité de détection des variants pour différentes tailles de panel et quantités d’ADN initial
24 échantillons HapMap ont été combinés pour obtenir des fréquences alléliques (VAF) descendant jusqu’à 2 %. 25, 50, 100, 200 et 500 ng de ce pool d’ADN ont été enrichis avec des NEBNext Direct Custom Ready Panels de 1, 10, 25, 50 et 100 gènes. Les panels de grande taille comprenaient les gènes des panels de petite taille. Les banques obtenues ont été séquencées par séquençage Illumina (2 x 150 pb), et les variants ont été détectés à l’aide des algorithmes Mutect et Vardict.
Avec NEBNext Direct Custom Ready Panels, les cibles se comportent de manière constante quelle que soit la taille du panel
Ce profil de couverture IGV pour 4 exons du gène BRAF faisant partie de panels de 1, 10, 25, 50 et 100 gènes montre un comportement constant des cibles malgré l’ajout de gènes cibles. 100 ng d’ADN initial ont été enrichis avec les 5 panels NEBNext contenant le gène BRAF. Les banques ont été soumises à un séquençage Illumina (2 x 150 pb).
Plus d’informations disponibles dans la section Ressources Techniques ou sur neb.com
